Ψ-RIP技术服务假尿嘧啶化RNA免疫共沉淀(Ψ RNA immunoprecipitation,Ψ-RIP)是研究RNA假尿嘧啶化修饰的实验技术。其实验原理为使用抗假尿嘧啶抗体特异识别假尿嘧啶化RNA,形成抗体-RNA复合物,通过与免疫共沉淀相似的方法,使用琼脂糖微珠或磁珠捕获并富集抗体-RNA复合物,洗脱后利用qPCR或高通量测序分析获取的RNA。
技术流程概述: 1、细胞裂解与RNA提取 组织先裂解重悬为单细胞悬液;裂解培养细胞或者组织细胞悬液,提取总RNA,并用DNA酶消化内源性DNA,降低干扰。 2、RNA质检与定量 3、RNA片段化 使用超声处理RNA样品,RNA打断为约平均100nt的片段。 4、免疫沉淀 使用抗假尿嘧啶抗体特异识别假尿嘧啶化RNA,再以Protein A、Protein G 或Protein A/G的琼脂糖微珠或磁珠捕获抗体获取目的抗体-RNA复合体,通过离心或磁力架分离纯化目的抗体-RNA复合物。 5、收集与RNA重抽提 利用洗涤液清洗收集的微珠/磁珠抗体-RNA复合物,其后加入蛋白酶K消化,释放RNA;使用提取试剂,重新抽提RNA。 6、分析检测 通过qPCR或高通量测序检测分析获得的RNA。 结果展示:
客户提供的材料与信息: 1、目标RNA信息; 2、细胞样本,细胞量不低于3×10^7个细胞; 3、组织样本不低于1g; 4、或实验方案设计。 下一篇O8G RIP技术服务
文章分类:
表观-RNA
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