如何预测tsRNA的靶基因

如何预测tsRNA的靶基因

How to predict targets of tsRNA

       转运RNA（tRNA）衍生的tsRNA（tRNA-derived small RNA）是一类新型的小非编码RNA（small non-coding RNA, sncRNA），参与调控mRNA干扰、稳定性和翻译。因此，靶基因预测对于tsRNA的研究十分重要。本文将讲解如何预测tsRNA的靶基因。

Transfer RNA (tRNA)-derived small RNA (tsRNA) is a novel type of small non-coding RNA (sncRNA), contributing to mRNA interference, stability and translation. Therefore, target prediction is critical for studying tsRNA.

对于已知的tsRNAs，靶基因预测步骤如下：

For known tsRNAs, the steps of target prediction are as follows:

1从https://rna.sysu.edu.cn/tsRFun/index.php网址进入tsRFun

1 Enter tsRFun from https://rna.sysu.edu.cn/tsRFun/index.php

2点击tsRNetwork

2 Click tsRNetwork

3输入tsRNA id/名称，搜索

3 Enter tsRNA id/name, search

4查看结果

4 View results

对于新发现的tsRNAs，靶基因预测步骤如下：

For novel tsRNAs, the steps of target prediction are as follows:

1从https://mirdb.org/index.html网址进入miRDB

1 Enter miRDB from https://mirdb.org/index.html

2点击Custom Prediction

2 Click Custom Prediction

3选择物种（如人类）以及提交核酸片段类型（miRNA Sequence）

3 Select Species (Human) and Submission type (miRNA Sequence)

4输入tsRNA序列，搜索

4 Enter tsRNA sequence, Go

5检索预测结果

5 Retrieve prediction result

6查看结果

6 View results